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篇1:黄瓜CsEXP 10基因的电子克隆及生物信息学分析
黄瓜CsEXP 10基因的电子克隆及生物信息学分析
以黄瓜CsEXP10 cDNA片段为信息探针,利用电子克隆和序列拼接方法获得了1191bp的cDNA序列.应用生物信息学软件预洲了该蛋日的`理化性质、卷曲螺旋、疏水性、信号肽、跨膜结构、糖基住点、活性位点、亚细胞定位及二级和高级结构.结果表明:该蛋白是一个疏水性稳定蛋白,定位于细胞壁,含有4个α-螺旋,11个β-折叠,5个跨膜区域,10个糖基化位点,具有催化域和多糖结合域两个结构域.
作 者:孙涌栋 张传来 罗未蓉 张兴国 SUN Yong-dong ZHANG Chuan-lai LUO Wei-rang ZHANG Xing-guo 作者单位:孙涌栋,张传来,罗未蓉,SUN Yong-dong,ZHANG Chuan-lai,LUO Wei-rang(河南科技学院园林学院,新乡,453003)张兴国,ZHANG Xing-guo(西南大学园艺园林学院,重庆,400715)
刊 名:生物信息学 ISTIC英文刊名:CHINA JOURNAL OF BIOINFORMATICS 年,卷(期): 6(3) 分类号:Q343.1 关键词:黄瓜 CsEXP10基因 电子克隆 生物信息学篇2:一个玉米氯离子通道基因(clc)的电子克隆及生物信息学分析
一个玉米氯离子通道基因(clc)的电子克隆及生物信息学分析
氯离子通道植物生理代谢中起着重要的角色.通过电子克隆的方法获得玉米氯离子通道的cDNA全长序列.发现该基因包括5个外显子和4个内含子,并对其表达产物进行生物信息学分析,其表达产物与拟南芥ATCLC-A,ATCLC-B具有较高的'相似性.
作 者:张桂荣 ZHANG Gui-rong 作者单位:河北科技师范学院图书馆,河北,秦皇岛,066004 刊 名:华北农学报 ISTIC PKU英文刊名:ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA 年,卷(期): 24(z2) 分类号:Q785 关键词:玉米 clc 氯离子通道 电子克隆 生物信息学 Zea mars clc Chloride channel In silico Cloning Bioinformatic篇3:猪APOBEC3F基因电子克隆
猪APOBEC3F基因电子克隆
从EST序列着手直接寻找新基因,即利用计算机进行同源性和一致性分析、寻找感兴趣的.EST、构建包含着KST的重叠群,再进行ORF判定以及蛋白质同源性分析.最终利用生物信息学技术克隆获得了猪的APOBFE3F序列.
作 者:吴小霞 马义才 WU Xiao-xia MA Yi-cai 作者单位:吴小霞,WU Xiao-xia(琼台师范高等专科学校,海南,海口,571100)马义才,MA Yi-cai(电子科技大学生命科学与技术学院,四川,成都,610054)
刊 名:生物信息学 ISTIC英文刊名:CHINA JOURNAL OF BIOINFORMATICS 年,卷(期): 6(3) 分类号:Q959.842 关键词:猪 ESTs APOBEC3F 电子克隆篇4:猪T细胞受体γ链基因的克隆及生物信息学分析
猪T细胞受体γ链基因的克隆及生物信息学分析
目的:克隆猪T细胞受体γ链(pTCR-γ)基因,用以研究猪T细胞受体分子结构与功能.方法与结果:以GenBank上登载的pTCR-γ基因为参考序列,用RT-PCR法从猪外周血淋巴细胞中克隆pTCR-γ基因.序列分析表明,pTCR-γ基因开放读框为1026 bp,编码341个氨基酸残基,合有由23个氨基酸残基构成的信号肽序列;与参考序列相比,在核苷酸和推导氨基酸序列上的同源性分别为95.6%和88.8%;系统进化分析发现,该基因与绵羊、恒河猴、人、马、牛的同源性相对较高,与褐鼠、家犬、家鼠、家猫的同源性次之,而与禽类、鱼类的同源性最低;生物信息学结构预测表明猪T细胞受体γ链含2个结构域,其中1个为IG_LIKE1结构域(IGv结构域),由第14~114位共101个氨基酸残基组成;另一个为IG_LIKE2结构域(IGc结构域),由第143~238位共96个氨基酸残基组成.结论:克隆并应用生物信息学技术分析了猪T细胞受体γ链基因序列及编码蛋白的.结构特征,为进一步研究γ链的结构与功能奠定了基础.
作 者:李玩生 房永祥 曾爽 景志忠 LI Wan-Sheng FANG Yong-Xiang ZENG Shuang JIHG Zhi-Zhong 作者单位:中国农业科学院,兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室,农业部兽医公共卫生重点实验室,甘肃省动物寄生虫病重点实验室,甘肃,兰州,730046 刊 名:生物技术通讯 ISTIC英文刊名:LETTERS IN BIOTECHNOLOGY 年,卷(期): 21(2) 分类号:Q78 关键词:猪T细胞受体γ链 基因克隆 生物信患学 结构预测篇5:野猪甘露聚糖结合凝集素A基因的克隆及其生物信息学分析
野猪甘露聚糖结合凝集素A基因的克隆及其生物信息学分析
根据GenBank上已发表的猪甘露聚糖结合凝集素A基因序列,设计一对特异性引物,通过RT-PER法成功地从野猪肝脏中克隆到MBL-A基因序列.该克隆基因全长为875 bp,包含MBL-A的完整开放阅读框.同源性分析显示野猪MBL-A基因与家猪核苷酸序列同源性在99%,推导的氨基酸序列同源性为100%;与其他哺乳动物相比核苷酸序列同源性在73%-83%之间,推导的.氨基酸序列同源性在60%-81%之间.
作 者:孙玉刚 刘玉芬 王洋 满朝来 赵文阁 Sun Yugang Liu Yufen Wang Yang Man Chaolai Zhao Wenge 作者单位:哈尔滨师范大学生命科学与技术学院,哈尔滨,150025 刊 名:野生动物 英文刊名:CHINESE JOURNAL OF WILDLIFE 年,卷(期):2009 30(2) 分类号:Q953+3 关键词:野猪 甘露聚糖结合凝集素A 基因克隆 序列分析文档为doc格式